
Биоинформатик долголетие / биогеронтология, Москва.
▷ Работодатель: Insilico Medicine Inc
(профиль,отзывы)
💰 From 0 RUR. | Режим: office |
10
* This listing is inactive or archived *
Обязанности:
- Регулярное исследование литературы по тематике геронтологии
- Проработка плана биоинформатического исследования
- Поиск выборок для исследований в базах биологических данных (GEO, ENA, ClinicalTrials, etc)
- Подготовка репрезентативных выборок для поиска биомаркеров старения
- Статистический анализ и моделирование биологических данных
- Решение задач классификации и регрессии биологических данных
- Подготовка отчётов, публикаций, грантов, патентов
- Знание базиса молекулярной биологии, ключевых метаболических процессов
- Базовое знание биологии старения: механистические теории старения, эволюционные теории старения, ассоциированные с возрастом болезни (болезнь Альцгеймера, кардиоваскулярные расстройства, саркопения, рак, etc)
- Знание процессов клеточной смерти, клеточного цикла, перерождения
- Опыт работы с омиксными данными: транскриптом, метилом, метагеном
- Оценка качества работы классификаторов и регрессоров
- Понимание метрик R2, MSE, MAE, Pearson’s R, AUC, recall, P-value, E-value, CI
- Знание основных вероятностных распределений, умение предугадать распределение величины по описанию порождающего её процесса
- Понимание принципов работы и областей применения таких моделей, как регрессия Кокса, байесовский вывод, cкрытые марковские модели
- Опыт работы с алгоритмами кластеризации (k-means, hierarchical methods, canopy) и снижения размерности (SOM, PCA, UMAP)
- Навыки формализации реальных задач, формирования и проверки гипотез
- Обширный опыт работы с пакетами pandas, numpy, sklearn, scipy, requests, json, re
- Составление пакетов и скриптов для единообразного анализа биологических данных коллегами и коллабораторами
- Общее знакомство с синтаксисом R и опыт работы с пакетами для обработки биологических данных (Bioconductor)
- Понимание и возможность применения основных типов графиков: scatter plot, box plot, bar plot, histogram, radar plot, heatmap, dendrogram, volcano plot, violin plot, KDE plots, facet grids
- Свободное владение хотя бы одним пакетом для визуализации данных (plotly, vega, seaborn, matplotlib, ggplot2)
- Опыт работы с программами для обработки готовых изображений (paint.net, Photoshop, Adobe Illustrator)
- English Upper-Intermediate (написание научно-популярных пресс-релизов, статей для рецензируемых журналов, ведение переговоров, в том числе с патентными юристами)
Желательно:
- Опыт работы с пакетами statsmodels, lifelines, pymc3 и прочими пакетами для решения специфических задач из области статистики
Условия:
-
Работа в офисе в Технопарке Сколково
-
Гибкий график и возможность работать удаленно несколько дней в неделю
-
Амбициозные и интересные задачи
-
Перспективы карьерного роста
-
Драйвовая команда, открытая к новым идеям и тестам. Сможешь работать в окружении умных людей, которые любят то, что делают
-
Возмещение трат на образовательные курсы и оплата профильных конференций
-
Бесплатная парковка для мотоциклов
Москва, Западный административный округ, Можайский район, Инновационный центр Сколково, район Технопарк,
http://www.insilicomedicine.com
RпубликацииБиологические исследованияКонференцииПатентынаучная работагеронтологияPython